ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารชีวภาพที่มีโครงสร้างไอโซควิโนลีน หมู่ฟังก์ชันอัลดีไฮด์และคลอรีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกได้ สามารถสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกซับซ้อนที่พบในยาต้านมะเร็ง ต้านจุลชีพ และต้านการอักเสบ ใช้ทั่วไปในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างอนุพันธ์และปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้น