ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพจากโครงสร้างไอโซควิโนลีน หมู่บรอมเมทิลที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้เกิดการอัลคิลเลชันหรือปฏิกิริยาคัปปลิงได้สะดวก ทำให้มีคุณค่าในการสร้างฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจนซับซ้อน นิยมใช้ในเคมียาเพื่อสร้างสารที่มีศักยภาพต้านมะเร็ง ต้านจุลชีพ และสารสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและสารที่มีฉลากสำหรับการทดสอบทางชีเคมี เนื่องจากโครงสร้างไอโซควิโนลีนมีคุณสมบัติเรืองแสงโดยธรรมชาติ