4-Acetylisoquinoline ถูกใช้หลักในสาขาเคมีทางการแพทย์เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา therapeutic ที่มีศักยภาพ รวมถึงยาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ นักวิจัยใช้สารนี้ในการออกแบบและสังเคราะห์โมเลกุลใหม่ที่สามารถกำหนดเป้าหมายไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางของโรค นอกจากนี้ 4-Acetylisoquinoline ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างสารประกอบ heterocyclic ที่ซับซ้อน ซึ่งมักถูกสำรวจสำหรับคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปถึงการสังเคราะห์อินทรีย์ ที่ซึ่งมันถูกใช้ในการเตรียมสารเคมีละเอียดและวัสดุพิเศษ