สารประกอบนี้ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) กลุ่มปกป้อง tert-butoxycarbonyl (Boc) ของมันมีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์ ซึ่งช่วยปกป้องส่วนประกอบอะมีนระหว่างปฏิกิริยา อนุญาตให้ถอดการปกป้องแบบเลือกสรรเมื่อจำเป็น นอกจากนี้ โครงสร้าง isoindoline ทำให้มีประโยชน์ในการออกแบบสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้ เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ กลุ่มกรดคาร์บอกซิลิกของมันยังช่วยให้สามารถทำการเชื่อมต่อหรืออนุพันธ์ได้ ซึ่งขยายประโยชน์ในการใช้ในเคมียารักษาและการค้นพบยา