ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการเตรียมสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากสามารถสร้างโครงสร้างเฮเตอร์โรไซคลิกที่เสถียร กลุ่มฟังก์ชันอะมิโนและคาร์บอนิลช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบและปรับปรุงยา นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างโปรบเรืองแสงและสีย้อม เนื่องจากโครงสร้าง isoindole ที่แข็งแรง ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรต่อแสงและคุณสมบัติการปล่อยแสง