ใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ กลุ่มไอโซไซยาเนตช่วยให้ทำปฏิกิริยากับเอมีน แอลกอฮอล์ และนิวคลิโอไฟล์อื่นๆ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างยูรีเทน ยูเรีย และอนุพันธ์อื่นๆ นอกจากนี้ อะตอมฟลูออรีนสามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรของสารที่ได้ ทำให้มีประโยชน์ในการพัฒนาส่วนผสมออกฤทธิ์สำหรับยาและยาฆ่าแมลง นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีโพลิเมอร์เพื่อปรับคุณสมบัติวัสดุ เช่น การปรับปรุงความทนทานต่อความร้อนและสารเคมีในสารเคลือบและกาว