กรดไฮโดรฟลูออริกใช้ในอุตสาหกรรมต่างๆ เป็นหลักในการกัดกร่อนแก้วและวัสดุเซรามิก เนื่องจากสามารถทำปฏิกิริยากับซิลิกาได้อย่างมีประสิทธิภาพ จึงนิยมใช้ในกระบวนการผลิตแผงวงจรไฟฟ้าและชิ้นส่วนอิเล็กทรอนิกส์เพื่อกำจัดคราบออกไซด์บนพื้นผิวซิลิคอน

นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมปิโตรเลียมเพื่อปรับปรุงคุณภาพของน้ำมัน โดยทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการแอลคิเลชัน ซึ่งช่วยเพิ่มค่าออกเทนของน้ำมันเชื้อเพลิง

ในอุตสาหกรรมโลหะ กรดไฮโดรฟลูออริกใช้ในการกำจัดสนิมและออกไซด์จากผิวโลหะผสม รวมถึงการเตรียมพื้นผิวก่อนชุบผิวหรือเคลือบ

ยังมีการใช้งานในการผลิตฟลูออโรคาร์บอนและสารทำความเย็น รวมถึงในผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดในครัวเรือน เช่น ยากำจัดสนิมและน้ำยาล้างคอนกรีต เพื่อละลายคราบแร่ธาตุ

มีการใช้งานในห้องปฏิบัติการ เช่น การย่อยตัวอย่างแร่หรือวัสดุที่มีซิลิกาสูง เพื่อวิเคราะห์องค์ประกอบทางเคมี

เนื่องจากมีความเป็นพิษสูงและกัดกร่อนรุนแรง การใช้งานต้องระมัดระวังอย่างมากและต้องใช้มาตรการป้องกันอันตรายอย่างเข้มงวด