ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสและยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง หมู่ฟังก์ชันอัลดีไฮด์ช่วยให้สามารถดริวาตีไซซ์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในเคมีเภสัชเพื่อการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม เนื่องจากโครงสร้างอินโดไลน์ที่แข็งและความสามารถในการเลียนแบบโครงสร้างเชิงพื้นที่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและวัสดุฟังก์ชันนัล โดยที่อัลดีไฮด์อะโรมาติกทำหน้าที่เป็นชิ้นส่วนพื้นฐานในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างโครงสร้างของสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็งและสารต้านจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้างที่สามารถทำปฏิกิริยาต่อเนื่องได้หลากหลายรูปแบบ จึงเป็นสารสำคัญในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และการค้นคว้ายาใหม่ๆ