ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารยับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างอินโดลีนของมันมีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างวงแหวนเฮเตอโรไซคลิกที่มีไนโตรเจน ซึ่งพบได้บ่อยในยาที่เล็งเป้าไปที่มะเร็ง การอักเสบ และโรคทางระบบประสาท กลุ่มฟังก์ชันบรอมโมช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงเพิ่มเติม เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งช่วยให้สามารถนำเข้าหมู่ย่อยที่หลากหลายได้ กลุ่ม tert-butyl carbamate (Boc) ทำหน้าที่เป็นอะมีนที่ถูกป้องกัน ช่วยอำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยาเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน ใช้กันทั่วไปในสถานที่วิจัยสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อนในโปรแกรมค้นพบยา