5-Iodo-1H-indole-3-carboxylic acid ถูกนำมาใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารประกอบชีวภาพ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาที่มีฐานอินโดล ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการรักษาโรคต่าง ๆ สารนี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบของเอนไซม์และการจับกับตัวรับ เนื่องจากโครงสร้างที่คล้ายคลึงกับอินโดลที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร สนับสนุนการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช โมเลกุลไอโอดีนทำให้มีคุณค่าในการศึกษาการติดฉลากด้วยรังสีสำหรับติดตามเส้นทางชีวเคมี โดยเฉพาะในด้านเคมีเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์ เพื่อค้นหาสารที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่าง ๆ รวมถึงโรคมะเร็งและโรคทางระบบประสาท