3-Bromo-4-cyanoindole ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในวงการเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น อินโดลและอนุพันธ์ของอินโดล ซึ่งเป็นโครงสร้างพื้นฐานที่สำคัญในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบที่ใช้ในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะยาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทหรือยารักษาโรคมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้เป็นตัวเลือกที่ดีในการพัฒนายาใหม่ ๆ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในด้านวัสดุศาสตร์ เพื่อพัฒนาวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น วัสดุเรืองแสงหรือสารกึ่งตัวนำ