สารเคมีนี้ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาเภสัช โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบยาใหม่ โครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มฟลูออโรและเมทอกซี่ ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติทางรักษา มักใช้ในการออกแบบตัวยับยั้งที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยเฉพาะในสาขามะเร็งวิทยาและระบบประสาท นอกจากนี้ อาจใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยแกนอินโดลช่วยในการสร้างสารที่มีฤทธิ์กำจัดศัตรูพืชหรือวัชพืช การประยุกต์ใช้ส่วนใหญ่เป็นการทดลอง มุ่งเน้นการปรับปรุงกิจกรรมทางชีวภาพและประสิทธิภาพในระบบเป้าหมาย