Ethyl 6-cyano-1H-indole-2-carboxylate ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายาและสารชีวภาพต่างๆ โครงสร้างแกน indole มีความสำคัญในเคมียารักษา มักใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร สนับสนุนการสร้างยาฆ่าแมลงและวัชยากร กลุ่มฟังก์ชันไซยาโนและเอสเตอร์ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีค่าในการปรับเปลี่ยนเคมีเพิ่มเติม สามารถผลิตอนุพันธ์หลากหลายที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้