เมทิล 7-ฟลูออโร-1H-อินโดล-2-คาร์บอกซิเลต ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาในสาขเภสัชวิทยา โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและจิตเวช โครงสร้างของมันมักถูกนำมาใช้ในการสร้างโมเลกุลที่โต้ตอบกับตัวรับเซโรโทนิน ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยาแก้ซึมเศร้า ยากล่อมประสาท และยารักษาโรคจิต นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในเคมียารักษาเพื่อพัฒนายาต้านการอักเสบและยารักษามะเร็งใหม่ๆ เนื่องจากแกนอินโดลซึ่งเป็นโครงสร้างทั่วไปในการค้นคว้ายา นักวิจัยยังสำรวจอนุพันธ์ของมันสำหรับศักยภาพในการรักษาโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท เช่น อัลไซเมอร์และพาร์กินสัน