6-Bromo-5-chloro-1H-indole เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ มันมักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารประกอบอินโดล (indole derivatives) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เช่น การพัฒนายาต้านมะเร็ง ยาต้านไวรัส และยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารต่างๆ ในระดับโมเลกุล