4,6-DIBROMO ISATIN เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกต่าง ๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ รวมถึงยาที่มีศักยภาพในการต้านมะเร็งและต้านจุลชีพ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี เนื่องจากสามารถสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อนได้ อะตอมโบรมีนในโครงสร้างทำให้เป็นสารเคมีที่เป็นประโยชน์ในปฏิกิริยาโบรมีเนชัน เพื่ออำนวยความสะดวกในการสร้างสารประกอบโบรมีนอื่น ๆ นักวิจัยยังนำมาใช้ในการศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และกิจกรรมการจับกับตัวรับ