สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารประกอบทางเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์อินโดล กลุ่มฟังก์ชันไนโตรและไอโอโดทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม เช่น ปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง ซึ่งจำเป็นต่อการค้นพบและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงสารต้านมะเร็งและต้านจุลินทรีย์ที่มีศักยภาพ เนื่องจากแกนอินโดลมีความสำคัญในเคมีทางการแพทย์