3-Cyclohexyl-1H-indole นิยมใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาการออกแบบและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกลุ่มสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มันอาจถูกนำมาใช้เป็นโครงสร้างหลักหรือเป็นส่วนหนึ่งของโมเลกุลที่ซับซ้อนเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินศักยภาพในการต้านการอักเสบ ต้านมะเร็ง หรือการใช้งานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถจับกับโปรตีนหรือเอนไซม์เฉพาะได้อย่างมีประสิทธิภาพ