3-Bromoindolin-2-one ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารยับยั้ง kinase และยาต้านมะเร็ง เป็นโครงสร้างพื้นฐานในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติทางบำบัด นอกจากนี้ ใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบของเอนไซม์และพัฒนายาใหม่ที่กำหนดเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ อะตอมโบรมีนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติม ทำให้มีความยืดหยุ่นในเคมียารักษา