3-Acetyl-6-bromoindole ถูกใช้หลักในการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่าง ๆ มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารประกอบฐานอินโดล ซึ่งเป็นที่รู้จักในคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ นักวิจัยใช้มันเพื่อสำรวจยารักษาใหม่ที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และภาวะอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับสร้างโครงสร้างเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งช่วยในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและการออกแบบโมเลกุล กลุ่มฟังก์ชันบรอมโมและอะซีติลทำให้มันมีความยืดหยุ่นสำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม ส่งเสริมการพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีกิจกรรมชีวภาพที่ปรับแต่งได้