สารนี้ 3-(Methylthio)-5-nitro-1H-indole มีการใช้งานในด้านการวิจัยทางเคมีและชีววิทยา เนื่องจากโครงสร้างอินโดลที่มีทั้งหมู่ไนโตรและหมู่เมทิลไทโอ ทำให้มันมีศักยภาพในการศึกษาปฏิกิริยาต่างๆ ในห้องปฏิบัติการ มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อนมากขึ้น นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาเนื่องจากโครงสร้างของอินโดลที่พบในสารหลายชนิดที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ