5-Bromoindol-3-propionic acid ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่าง ๆ รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาอนุพันธ์อินโดล ซึ่งมีคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ เช่น ต้านการอักเสบ ต้านจุลินทรีย์ และต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษากลไกการยับยั้งเอนไซม์และการจับตัวรับ เนื่องจากโครงสร้างที่คล้ายกับสารอินโดลที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยใช้ในการสังเคราะห์วัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และสีย้อม