1-Methyl-6-nitro-1H-indole ใช้ในการวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาคุณสมบัติทางชีวภาพและปฏิกิริยาต่างๆ มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินศักยภาพในการเป็นสารต้านอนุมูลอิสระหรือสารต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่มีกลุ่มไนโตรซึ่งอาจมีผลต่อกลไกทางชีวเคมีในเซลล์