Ethyl 1-methyl-1H-indole-6-carboxylate มีการประยุกต์ใช้หลักในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการผลิตสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งสามารถใช้ในการสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร สนับสนุนการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โครงสร้าง indole ของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อกิจกรรมทางชีวภาพ นักวิจัยยังใช้สารนี้ในวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อพัฒนาวัสดุอินทรีย์ใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ