สารนี้มีการใช้งานหลักในอุตสาหกรรมการผลิตยา โดยเฉพาะในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของอินโดลมีบทบาทสำคัญในสารชีวโมเลกุลหลายชนิด ซึ่งการเติมหมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมัน ความเสถียรของโมเลกุล และการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้ดีขึ้น สารอนุพันธ์ของอินโดลที่มีหมู่ทริฟลูออร์เมทิลจึงมักถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท เช่น ยากดประสาท ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาต้านจิตประดิษฐ์ นอกจากนี้ยังมีศักยภาพในการใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารที่มีฤทธิ์ต้านการอักเสบ และฤทธิ์ต้านจุลชีพในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์ สารนี้ยังถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารประกอบที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่ต้องการการปรับเปลี่ยนโครงสร้างบริเวณตำแหน่งที่ 7 ของวงอินโดล ซึ่งช่วยให้ได้สารผลิตภัณฑ์ที่มีคุณสมบัติพิเศษตามต้องการ