ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการผลิตสารปรับตัวรับเซโรโทนินและสารประกอบอื่นๆ ที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท มีศูนย์ chiral และกลุ่ม amine ที่ได้รับการป้องกัน ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน ซึ่งช่วยรักษาความสมบูรณ์ของสเตอริโอเคมีในระหว่างปฏิกิริยาการจับคู่ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และไมเกรน ส่วนของอินโดลช่วยให้มีโครงสร้างคล้ายกับทริปโตเฟน ทำให้สามารถรวมเข้าไปในเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเพื่อเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับกับตัวรับ