ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์และสารชีวภาพ โครงสร้างของมันสนับสนุนการพัฒนาอนุพันธ์เบสอินโดล ซึ่งพบบ่อยในเคมียารักษาโรค ใช้บ่อยในการเตรียมอนุพันธ์ทริปตามีนและทริปโตเฟน มีบทบาทในการสังเคราะห์ตัวปรับตัวรับเซโรโทนินและสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทอื่นๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างโพรบเรืองแสงและสีย้อมเนื่องจากคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ของแกนอินโดล และทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์อนุพันธ์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและตัวยับยั้งคินาสในงานวิจัยมะเร็ง โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาเพื่อพัฒนายาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านซึมเศร้า และยาคลายกังวล รวมถึงสารที่มีฤทธิ์ต้านการอักเสบและต้านจุลชีพในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม