ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น สารที่มีผลต่อตัวรับเซโรโทนิน ซึ่งเกี่ยวข้องกับภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และการนอนหลับ นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างอินโดลมีศักยภาพในการยับยั้งการทำงานของเอนไซม์หรือโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง ยังมีการศึกษาในด้านเคมีเชิงสร้างสรรค์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะทางสำหรับการใช้งานในห้องปฏิบัติการวิจัย