ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตัวกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์และสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีโครงสร้างอินโดล หน้าที่ของโบรมีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม (cross-coupling reactions) ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้อย่างแพร่หลายในการเตรียมสารปรับตัวรับเซโรโทนิน (serotonin receptor modulators) และตัวยับยั้งคินาส (kinase inhibitors) นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมีการแพทย์สำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างหลัก (scaffold modification) ในโปรแกรมค้นคว้ายาใหม่ที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและมะเร็ง