ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์และวัสดุฟังก์ชันนัล อะตอมไอโอดีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยา cross-coupling เช่น Suzuki หรือ Heck reactions ซึ่งช่วยในการสร้างอนุพันธ์อินโดลที่ซับซ้อน นิยมใช้ในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ชีวภาพ รวมถึงสารต้านมะเร็งและต้านจุลินทรีย์ที่มีศักยภาพ ยังใช้ในการสังเคราะห์ลิแกนด์ตัวรับเซโรโทนินและโปรบทางประสาทเคมีอื่นๆ เนื่องจากแกนอินโดลพบมากในสารสื่อประสาท โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เช่น การพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารอนุพันธ์ที่มีหมู่ฟังก์ชันหลากหลายผ่านปฏิกิริยาแทนที่ของหมู่ไอโอดีน เช่น การทำปฏิกิริยากับสารประกอบออร์แกโนเมทัลลิก หรือการเชื่อมต่อแบบ cross-coupling ในการสร้างโครงสร้างยาใหม่ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อพัฒนาสารที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางจิตเวช โรคประสาทเสื่อม มะเร็ง หรือการติดเชื้อ เหมาะสำหรับการวิจัยในเคมียารักษาและการค้นพบยา