ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีสังเคราะห์เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เช่น การพัฒนายาที่มีเป้าหมายเกี่ยวกับระบบประสาทส่วนกลาง หรือสารที่ออกฤทธิ์ต่อตัวรับเซโรโทนิน นอกจากนี้ยังใช้เป็นโครงสร้างพื้นฐานในการสร้างสารฟลูออเรสเซนต์หรือสารเรืองแสงในงานวิเคราะห์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างอินโดลมีความสามารถในการดูดซับและปล่อยแสงได้ดี