ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านซึมเศร้าหรือยากระตุ้นการทำงานของสมอง นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานหรือตัวกลางในการวิเคราะห์ทางเคมีในห้องปฏิบัติการ เนื่องจากโครงสร้างอินโดลมีความสำคัญในสารชีวโมเลกุลหลายชนิด จึงทำให้สารนี้มีบทบาทในงานพัฒนายาใหม่ๆ ที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนหรือเอนไซม์เป้าหมายในร่างกาย