ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มที่มีผลต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น สารที่ออกฤทธิ์ต่อตัวรับเซโรโทนิน ซึ่งเกี่ยวข้องกับภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และการนอนหลับ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างอินโดลมีศักยภาพในการยับยั้งการทำงานของเอนไซม์บางชนิดที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อสร้างสารอนุพันธ์ใหม่สำหรับคัดกรองฤทธิ์ทางชีวภาพ