ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ สารประกอบนี้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนการสร้างระบบเฮเตอโรไซคลิกที่ซับซ้อนยิ่งขึ้น โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่มีโครงสร้างพื้นฐานเป็นอินโดล กลุ่มไนโตรช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติมได้ เช่น การรีดิวซ์เป็นกลุ่มอะมีน ซึ่งเอื้อต่อการจับคู่เปปไทด์หรือการสร้างพันธะอะไมด์ในเคมีเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและโพรบเรืองแสงเนื่องจากโครงสร้างแบบคอนจูเกต ฟังก์ชันคีโตนให้จุดสำหรับการโจมตีด้วยนิวคลีโอไฟล์หรือปฏิกิริยาการควบแน่น ทำให้มีคุณค่าในการสร้างความหลากหลายของโมเลกุลสำหรับการค้นพบยาใหม่