ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานอินโดล โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อนซึ่งพบในเคมียา ใช้บ่อยในงานวิจัยสำหรับการเตรียมลิแกนด์ตัวรับเซโรโทนินและสารเอเย่นต์ทางระบบประสาทอื่นๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสีย้อมและโพรบฟลูออเรสเซนต์ เนื่องจากธรรมชาติอะโรมาติกและอิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ของแกนอินโดล เหมาะสำหรับใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยกลุ่มเอสเตอร์ช่วยให้สามารถฟังก์ชันนาไลซ์เพิ่มเติมผ่านการไฮโดรไลซิส การรีดักชัน หรือปฏิกิริยาคัปปลิง ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารอนุพันธ์ของอินโดล ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายาในกลุ่มสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านการอักเสบ ยากระตุ้นระบบประสาท หรือสารต้านจุลชีพ และเป็นตัวกลางในการสร้างโครงสร้างหลักของอัลคาลอยด์บางชนิดที่พบในธรรมชาติ โดยเฉพาะที่มีโครงสร้างสัมพันธ์กับสารไซโคทรีปามีน