ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานอินโดลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านการอักเสบ ต้านไวรัส และต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อนมากขึ้นในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการออกแบบตัวยับยั้งคินาสและตัวปรับตัวรับเซโรโทนิน ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำวงแหวนอินโดลที่ถูกฟังก์ชันไนซ์เข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย