ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ตัวรับเซโรโทนิน (5-HT receptors) ซึ่งเกี่ยวข้องกับภาวะซึมเศร้า วิตกกังวล และโรควิตกกังวลอื่น ๆ นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างอินโดลมีศักยภาพในการยับยั้งการทำงานของเอนไซม์หรือโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อสร้างสารอนุพันธ์ใหม่ที่มีความจำเพาะและมีฤทธิ์แรงขึ้น