ใช้ในงานสังเคราะห์สารประกอบอินโดล ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในหลายสารชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาแก้ซึมเศร้า หรือสารต้านการอักเสบ เนื่องจากหมู่ tert-butyl carboxylate ช่วยป้องกันตำแหน่ง N ของอินโดลในขั้นตอนการสังเคราะห์ และสามารถกำจัดออกได้ภายหลังเมื่อต้องการเปิดตำแหน่งเดิมสำหรับการต่อเติมหมู่อื่น ส่วนหมู่เมธอกซีคาร์บอกซิลก็สามารถนำไปทำปฏิกิริยาต่อได้ เช่น การเปลี่ยนเป็นกรดหรือแอมไลด์ ทำให้มีความยืดหยุ่นสูงในการออกแบบสารใหม่