ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับยาและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารปรับตัวรับเซโรโทนินและสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทอื่นๆ นิยมใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck เพื่อสร้างสารอนุพันธ์อินโดลที่ซับซ้อนซึ่งมีศักยภาพในการต้านมะเร็ง ต้านไวรัส หรือต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์โปรบฟลูออเรสเซนต์และสีย้อมเนื่องจากแกนอินโดลมีคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่เหมาะสม หมู่โบรโมช่วยให้สามารถปรับแต่งได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยทางเคมียารักษาและการค้นพบยา