ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในงานสังเคราะห์ยา โดยมีหมู่อะมิโนที่ตำแหน่ง 5 และไซยาโนที่ตำแหน่ง 3 บนโครงสร้างอินโดล ซึ่งช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อเพื่อสร้างสารอนุพันธ์ได้หลากหลาย โดยเฉพาะในพัฒนายากลุ่มปรับตัวรับเซโรโทนิน ยากลุ่มระบบประสาทส่วนกลาง ยาต้านมะเร็ง ยาแก้ซึมเศร้า ยาต้านโรคจิต และยาต้านการอักเสบ โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกซับซ้อนที่พบในโมเลกุลชีวภาพ มีการใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยสังเคราะห์หลายขั้นตอนสำหรับสารอินโดลใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสีย้อมเรืองแสงและวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากระบบอะโรมาติกแบบคอนจูเกต