ไอซาทินถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่มีคุณสมบัติต้านไวรัส ต้านมะเร็ง และต้านจุลชีพ สารอนุพันธ์ของมันถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการรักษาโรค เช่น เอชไอวี วัณโรค และมะเร็งบางประเภท ในเคมีอินทรีย์ ไอซาทินทำหน้าที่เป็นหน่วยก่อสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอโรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนาสีย้อม สารให้สี และสารเคมีทางการเกษตร นอกจากนี้ สารประกอบที่ตั้งต้นจากไอซาทินยังถูกศึกษาในด้านประสาทวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะการยับยั้งเอนไซม์ เช่น โมโนเอมีนออกซิเดส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการรักษาความผิดปกติทางระบบประสาท การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่วิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งถูกใช้ในการพัฒนาวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และเซ็นเซอร์