7-Chloroisatin ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและจิตเวช มีบทบาทในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพต้านการอักเสบ ต้านจุลชีพ และต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์สำหรับการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมีคุณค่าในเคมียารักษาและการค้นพบยา สารอนุพันธ์ของมันยังถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการรักษาโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท เนื่องจากมีโครงสร้างที่สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อสร้างสารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ และมีการศึกษาการนำไปใช้ในกระบวนการทางเคมีวิเคราะห์เพื่อตรวจหาสารต่างๆ เนื่องจากมีความไวและความจำเพาะสูง