6-Hydroxyindole ถูกนำมาใช้หลักในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาและสารชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาอนาล็อกเซโรโทนินและอนุพันธ์อินโดลอื่นๆ ซึ่งมีความสำคัญในงานวิจัยยาสำหรับระบบประสาทและจิตเวช นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี เนื่องจากสามารถสร้างคอมเพล็กซ์สีที่เสถียรได้ ในงานศึกษาทางชีวเคมี 6-Hydroxyindole ใช้ในการตรวจสอบกระบวนการเอนไซม์และเส้นทางเมแทบอลิซึมที่เกี่ยวข้องกับสารประกอบอินโดล บทบาทของมันในการสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและเคมีภัณฑ์ละเอียดยิ่งเน้นย้ำถึงความสำคัญในงานวิจัยอุตสาหกรรมและวิชาการ