ใช้หลักในการวิจัยทางเภสัชกรรม 6-Chloro-4-methyl-7-azaindole เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าสำคัญในการพัฒนายับยั้ง kinase ซึ่งจำเป็นสำหรับการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์เฉพาะที่เกี่ยวข้องกับโรค เช่น มะเร็ง นอกจากนี้ ยังใช้ในการสร้างโปรบฟลูออเรสเซนต์สำหรับการศึกษาทางชีวเคมี ช่วยในการแสดงภาพและทำความเข้าใจกระบวนการในเซลล์ ความยืดหยุ่นของมันยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ โดยมีส่วนช่วยในการออกแบบวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์