5-Cyano-7-azaindole ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการวิจัยและพัฒนายา เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ ทำให้มันมีศักยภาพในการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบใหม่ๆ ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกลุ่มของสารยับยั้งเอนไซม์และสารต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเรืองแสงสำหรับการตรวจสอบทางชีวภาพและการถ่ายภาพระดับโมเลกุล ซึ่งช่วยในการติดตามและวิเคราะห์กระบวนการทางชีวเคมีในเซลล์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ