5-Chloroindole-2-carboxylic acid เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมีเพื่อสร้างสารประกอบอินโดลที่ซับซ้อน ซึ่งมักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาและสารกำจัดศัตรูพืช นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคต่าง ๆ เนื่องจากโครงสร้างอินโดลที่มีศักยภาพในการออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา อีกทั้งยังมีบทบาทในการวิจัยทางเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาปฏิกิริยาและการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลให้มีประสิทธิภาพมากขึ้น