4-Bromo-5-fluoro-1H-indole ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบอินโดลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ สารนี้มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งอาจมีศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ เช่น โรคมะเร็ง โรคทางระบบประสาท และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อนำไปใช้ในการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงและผลข้างเคียงน้อย เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพทางเภสัชวิทยา