6-chloro-1H-indole-3-carboxylic acid ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา 기반อินโดล ซึ่งเป็นที่รู้จักจากกิจกรรมทางชีวภาพที่หลากหลาย นักวิจัยมักนำมาใช้ในการสังเคราะห์ตัวแทนบำบัดที่อาจเป็นไปได้สำหรับภาวะต่างๆ เช่น การอักเสบ มะเร็ง และความผิดปกติทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษากลไกทางชีวเคมีและปฏิสัมพันธ์ของตัวรับ เนื่องจากสามารถเลียนแบบอนุพันธ์อินโดลจากธรรมชาติได้ บทบาทของมันในเคมียารักษาโรคแสดงให้เห็นถึงความสำคัญในการพัฒนาการค้นพบและพัฒนายา