6-Methyl-1H-indole-4-carboxylic acid ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการพัฒนาเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพทางชีวภาพ เช่น สารต้านการอักเสบหรือต้านจุลชีพ

นอกจากนี้ ยังนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาบทบาทในการสังเคราะห์อนุพันธ์อินโดล ซึ่งมีความสำคัญในการค้นพบและพัฒนายา โครงสร้างของมันที่มีความคล้ายคลึงกับสารประกอบอินโดลในธรรมชาติ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารที่โต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ

มีการนำไปประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อพัฒนาสารเคมีเฉพาะทางและกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ที่ซับซ้อน