อินโดล-2-คาร์บอกซิลิกแอซิดถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารชีวภาพต่างๆ มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท รวมถึงยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต เนื่องจากโครงสร้างที่คล้ายคลึงกับสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตยาต้านการอักเสบและยาต้านจุลชีพ ซึ่งช่วยในการรักษาการติดเชื้อและภาวะอักเสบ ในงานวิจัยทางเกษตรเคมี มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เพื่อช่วยปกป้องพืชผล ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่การสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งถูกนำมาใช้ในการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม